Eine alte Legende auf Hitogashima, einer kleinen Insel mit nur wenigen tausend Einwohnern, besagt, dass es Wesen gibt, die das Aussehen und die Persönlichkeit eines Menschen annehmen und diesen dann klammheimlich verschwinden lassen. Sie werden Schatten genannt, und nachdem sie ihr Opfer beseitigt haben, sollen sie an dessen Stelle ganz normal weiterleben, als wäre nichts gewesen. Doch die Bewohner Hitogashimas sollen schon bald erfahren, dass an dieser Legende womöglich mehr dran sein könnte, als ihnen lieb ist.
Nach dem Tod seiner Eltern wurde Shinpei Ajiro von der Kofune-Familie großgezogen. Mit seinen beiden Stiefschwestern Ushio und Mio verstand er sich immer bestens, dennoch verlässt er nach der Mittelschule Hitogashima, um eine Oberschule in Tokio zu besuchen. Als ihn jedoch eines Tages die Nachricht von Ushios plötzlichem Tod erreicht, kehrt er sofort in seine Heimat zurück. Gerade rechtzeitig am Tag der Beerdigung angekommen, scheint bis auf Ushios Abwesenheit zunächst alles wie früher. Ihre Todesumstände jedoch kommen Shinpei sehr sonderbar vor: Nicht nur soll die sonst ausgezeichnete Schwimmerin bei dem Versuch, die junge Shiori Kobayakawa zu retten, ertrunken sein; zusätzlich sind um ihren Hals herum merkwürdige Verletzungen sichtbar, die auf eine andere Todesursache schließen lassen. Und als wäre das noch nicht genug, verschwindet Shiori direkt am nächsten Morgen – mitsamt ihrer ganzen Familie! Shinpei und Mio beschließen, einmal bei der verschwundenen Familie vorbeizuschauen, und auf ihrer Suche werden sie auch fündig. Allerdings treffen sie nicht auf die kleine Shiori, sondern auf … Mio?! Oder besser gesagt: ihren Schatten! Dieser sieht zwar genau so süß und unschuldig aus wie Mios wahres Ich, macht aber mit den beiden kurzen Prozess. Was wie das Ende einer Geschichte klingt, ist jedoch gerade erst der Anfang, denn im nächsten Moment befindet sich Shinpei wieder auf der Fähre in Richtung Hitogashima …
